Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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