Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms