Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C1orf61Q13536 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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C1orf61Q13536 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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C1orf61Q13536 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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C1orf61Q13536 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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C1orf61Q13536 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C1orf61Q13536 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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