Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 BLNK-204ENST00000427367 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC008543.2-201ENST00000436907 1383 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P22-201ENST00000437295 946 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PRKG1-AS1-203ENST00000452247 886 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC008770.1-204ENST00000489336 622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 HAUS1P2-201ENST00000439908 784 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 S100Z-202ENST00000513010 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.79-201ENST00000610676 290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC00958-201ENST00000504230 1558 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SFR1-201ENST00000369727 1438 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms