Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB3BPQ13352 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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