Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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CBX3Q13185 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CBX3Q13185 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CBX3Q13185 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CBX3Q13185 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CBX3Q13185 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CBX3Q13185 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CBX3Q13185 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CBX3Q13185 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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