Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms