Protein–RNA interactions for Protein: Q12912

LRMP, Lymphoid-restricted membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMPQ12912 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LRMPQ12912 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms