Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TROQ12816 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TROQ12816 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TROQ12816 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TROQ12816 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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