Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SYCNQ0VAF6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms