Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
LRP1Q07954 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms