Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DSC2Q02487 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms