Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MC1RQ01726 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms