Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HERVK_113P62684 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HERVK_113P62684 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms