Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GTF2A2P52657 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GTF2A2P52657 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms