Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RECQLP46063 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RECQLP46063 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RECQLP46063 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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