Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms