Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CXCR5P32302 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms