Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GTF2E1P29083 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms