Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLD1P28340 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLD1P28340 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms