Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ITGA3P26006 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ITGA3P26006 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ITGA3P26006 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ITGA3P26006 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms