Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PRKCHP24723 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCHP24723 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PRKCHP24723 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCHP24723 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PRKCHP24723 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PRKCHP24723 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PRKCHP24723 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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PRKCHP24723 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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PRKCHP24723 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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