Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TAF1P21675 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TAF1P21675 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TAF1P21675 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1P21675 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TAF1P21675 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms