Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NFKB1P19838 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NFKB1P19838 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NFKB1P19838 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NFKB1P19838 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NFKB1P19838 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NFKB1P19838 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NFKB1P19838 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NFKB1P19838 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NFKB1P19838 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NFKB1P19838 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NFKB1P19838 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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NFKB1P19838 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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