Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF1P10914 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF1P10914 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF1P10914 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IRF1P10914 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IRF1P10914 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF1P10914 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF1P10914 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms