Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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LTAP01374 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
LTAP01374 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LTAP01374 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LTAP01374 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LTAP01374 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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LTAP01374 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
LTAP01374 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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