Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LCA5LO95447 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms