Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
HOXA3O43365 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms