Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LRRTM2O43300 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LRRTM2O43300 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LRRTM2O43300 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LRRTM2O43300 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LRRTM2O43300 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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LRRTM2O43300 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LRRTM2O43300 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LRRTM2O43300 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LRRTM2O43300 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LRRTM2O43300 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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