Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms