Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF22A3QJZ6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF22A3QJZ6 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms