Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9Y3F1 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms