Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC8Q9Y2L5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms