Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms