Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CGGBP1Q9UFW8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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