Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLKQ9UBT6 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms