Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LHX3Q9UBR4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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