Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALCOCO1Q9P1Z2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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