Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFNKQ9P0W0 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms