Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM30AQ9NV96 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM30AQ9NV96 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms