Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD248Q9HCU0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms