Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHA8P1-202ENST00000336399 1524 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBP2-201ENST00000232217 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR13C9-201ENST00000259362 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SUN5-201ENST00000356173 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KRTAP9-4Q9BYQ2 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00970-201ENST00000366408 1129 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 C4BPB-202ENST00000367076 1113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 EMP1-202ENST00000396301 675 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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KRTAP9-4Q9BYQ2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 NMNAT3-214ENST00000514703 584 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090193.2-201ENST00000518970 537 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATM-209ENST00000526567 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007552.2-201ENST00000541892 603 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02409-201ENST00000547515 576 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 C6orf229-201ENST00000565469 814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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