Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms