Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RBBP8Q99708 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP8Q99708 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms