Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ECHDC3Q96DC8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ECHDC3Q96DC8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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