Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LRRN4Q8WUT4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms