Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms