Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
USP43Q70EL4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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