Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms