Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CSPP1Q1MSJ5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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